Genotipificación en introducciones de Capsicum chinense Jacq. mediante marcadores moleculares SSR fluorescentes

Autores/as

  • Rubén Darío Rojas Pantoja Facultad de Ciencias Agropecuarias. Universidad Nacional de Colombia sede Palmira, Colombia
  • José René Jiménez Cardona Centro de Gestión y Desarrollo Sostenible SurColombiano, SENA, Pitalito-Huila, Colombia
  • Daira Alicia del Pilar Cuarán Cuarán Facultad de Ciencias Agropecuarias. Universidad Nacional de Colombia sede Palmira, Colombia
  • Franco Alirio Vallejo Cabrera Facultad de Ciencias Agropecuarias. Universidad Nacional de Colombia sede Palmira, Colombia.
  • Raul Dirceu Pazdiora Universidad Federal de Rondônia- Departamento de Zootecnia, Campus Presidente Médici, Brasil
  • Creuci Maria Caetano Universidad Federal de Rondônia. Campus Presidente Médici, Brasil.

DOI:

https://doi.org/10.54502/msuceva.v3n1a8

Palabras clave:

Ají, análisis moleculares, fluorocromos, genotipos élite, variabilidad genética

Resumen

El objetivo del presente estudio fue utilizar marcadores SSR fluorescentes para seleccionar genotipos con amplia variabilidad genética, entre introducciones de C. chinense provenientes de México, Brasil y Colombia. En la genotipificación se empleó la plataforma Applied Biosystems 3730xI (Institute of Biotechnology, Cornell University) y la evaluación del tamaño de los alelos se realizó con el software GeneMapper 3.7 (Applied Biosystems). Los marcadores revelaron un total de 114 alelos con un promedio de 12 alelos por locus. El tamaño de los alelos osciló entre 91 y 341 pares de bases. El número de alelos por locus fue variable, de seis para Hpms 2-24 a 21 para Gpms -161. Las poblaciones estudiadas presentaron un índice de Shannon bajo. Las accesiones con mayor diversidad genética fue Brasil con I= 1.622, mientras las de Colombia fue la menor, con I= 0.995. Los valores medios de Ho fueron de 0.517 para Brasil, 0.317 para Colombia y 0.543 para México. Los valores medios de He fueron, en general, superiores a los observados. La tasa de He más baja se registró en accesiones colombianas (0.491), mientras la más alta en las mexicanas (0.719). El análisis de conglomerados mostró la conformación de tres grupos, diferenciados según el origen geográfico de los genotipos evaluados. Todos los cebadores mostraron bandas reproducibles, lo que demuestra su eficiencia para la cartografía genética y el etiquetado de genes en futuros estudios. El valor PIC refleja que la diversidad alélica y la frecuencia entre los genotipos fueron generalmente altas para los loci SSR probados.

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Biografía del autor/a

Rubén Darío Rojas Pantoja, Facultad de Ciencias Agropecuarias. Universidad Nacional de Colombia sede Palmira, Colombia

Graduado en Ingeniería Agronómica (2012), cuenta con Maestría en Ciencias Biológicas, con énfasis en Biotecnología Vegetal (2015) de la Universidad Nacional de Colombia, posee experiencia en el uso de herramientas de Biología Molecular para el diagnóstico de Fitopatógenos y estudios de diversidad Genética, Universidad de Buenos Aires UBA, Argentina (2014). Actualmente, es Director de cultivo de cannabis medicinal y flores de corte; liderando procesos agroindustriales en aspectos técnicos y administrativos de mejoramiento, propagación, producción, fertilización y sanidad vegetal

José René Jiménez Cardona, Centro de Gestión y Desarrollo Sostenible SurColombiano, SENA, Pitalito-Huila, Colombia

Graduado en Ingeniería Agronómica (2013), Maestría en Ciencias Biológicas, línea de investigación en recursos fitogenéticos neotropicales (2015); practica profesionalizante en citogenética y epigenética con validación de la diversidad genética de razas criollas e indígenas de maíz de Colombia (Brasil, 2014). Cuenta con experiencia en citogenética clásica y molecular, colecta y caracterización de material vegetal. Ha estado vinculado con la Universidad Nacional de Colombia, La Escola Superior de Agricultura “Luiz de Queiroz” de Sao Paulo, Brasil La Universidad Pontificia Bolivariana y el Centro de Gestión y Desarrollo Sostenible SurColombiano, SENA, Pitalito-Huila, Colombia.

Daira Alicia del Pilar Cuarán Cuarán, Facultad de Ciencias Agropecuarias. Universidad Nacional de Colombia sede Palmira, Colombia

Graduada como Ingeniera Agrónoma de la universidad nacional de Colombia- sede Palmira (2013); Especialista en Gestión de Asistencia Técnica Agropecuaria, Centro Latinoamericano de Especies Menores, SENA CLEM-Tuluá, Valle del Cauca, Colombia (2017). Magister en Ciencias Biológicas, Línea de Recursos Fitogenéticos Neotropicales, de la Universidad Nacional de Colombia sede Palmira (2022); labora como técnico agropecuario en el secretariado diocesano de pastoral social, proyecto de agricultura sostenible y desarrollo humano integral, Nariño-Colombia.

Franco Alirio Vallejo Cabrera, Facultad de Ciencias Agropecuarias. Universidad Nacional de Colombia sede Palmira, Colombia.

Ingeniero Agrónomo de la Universidad Nacional de Colombia, Magister en ciencias de la Universidad Nacional de Colombia; Instituto Colombiano Agropecuario, Doctor en Genética y Mejoramiento de Plantas de la Universidad de Sao Paulo, Brasil. Profesor Titular, Maestro Universitario, Profesor
Emérito de la Universidad Nacional de Colombia; Premio Nacional de Ciencias de la Fundación Alejandro Ángel Escobar (1994); Investigador Emérito de MinCiencias; Miembro de la Academia Colombiana de Ciencias Exactas, Física y Naturales.

Raul Dirceu Pazdiora, Universidad Federal de Rondônia- Departamento de Zootecnia, Campus Presidente Médici, Brasil

Profesor Asociado Nivel III de la Universidad Federal de Rondônia- Departamento de Zootecnia, Campus Presidente Médici, Brasil. Licenciado en Medicina Veterinaria por la Universidad Federal de Santa Maria (2005), Máster en Zootecnia (Producción Animal) por la misma institución (2008) y Doctor en Zootecnia (Producción Animal) por la Universidad Estadual de São Paulo Júlio de Mesquita (UNESP), campus Jaboticabal (2011). Tiene experiencia en Medicina Veterinaria y Zootecnia, con énfasis en Producción Animal-Ganado Bovino de Carne y Leche, trabajando principalmente en los siguientes temas: evaluación de alimentos, nutrición de rumiantes, mejoramiento genético y manejo animal.

Creuci Maria Caetano, Universidad Federal de Rondônia. Campus Presidente Médici, Brasil.

Graduada en Ciencias Biológicas (1981), con Maestría en Biología Celular (1995) y PhD en Ciencias Biológicas (2001) de la Universidade Estadual de Maringá (UEM), Paraná. Pedagoga (UEM; 1994), con un perfeccionamiento en Ciencia y Ciudadanía- Ethos Ciencia de la Faculdade Estadual de Campo Mourao, Paraná (1996). Especialización en Control y Gestión Ambiental (UEM, 1999) y Curso Internacional de Posgrado en Patrimonio Cultural, Turismo Sustentable y Paisaje Cultural (Fondo Verde; 2017). Sus áreas de actuación son la Citogenética Vegetal, la Etnobotánica aplicada, la Conservación y Utilización de Recursos Fitogenéticos (RFG). Ha estado vinculada con el Instituto Internacional de Recursos Fitogenéticos (IPGRI) (actual Bioversity International), la Universidad Nacional de Colombia y la Fundacao Universidade Federal de Rondônia, na Amazônia Ocidental Brasileira, campus Presidente Médici, Departamento de Engenharia de Pesca.

Citas

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Publicado

2023-07-01

Cómo citar

1.
Rojas Pantoja RD, Jiménez Cardona JR, Cuarán Cuarán DA del P, Vallejo Cabrera FA, Dirceu Pazdiora R, Caetano CM. Genotipificación en introducciones de Capsicum chinense Jacq. mediante marcadores moleculares SSR fluorescentes. Magna Sci. UCEVA [Internet]. 1 de julio de 2023 [citado 21 de junio de 2024];3(1):79-87. Disponible en: http://revistas.uceva.edu.co/index.php/magnascientia/article/view/70

Número

Sección

Bioquímica, Genética y Biología Molecular (Biochemistry, Genetics, Molecular Bio

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